Психолог и психофизиолог, доктор психологических наук (1963), профессор (1966). Основатель научного направления в психологии - материальные механизмы психики. Возглавлял (1952-1961 и с 1965) лабораторию высшей нейродинамики при институте психологии АПН РСФСР.
Им был предложен новый экспериментальный метод тестирующего стимула, позволяющий исследовать нейродинамику в ходе осуществления человеком разного рода умственных действий. Автор трудов "Мозг и психика" (1976), "Механизмы умственной деятельности человека" (1976), ставших научным открытием, они вошли в золотой фонд отечественной психологии. В последние годы Е.И. Бойко интересовался кибернетикой, возможностью применения кибернетических моделей при изучении центральной нервной системы.
Скончался Е.И. Бойко 13 ноября 1972 года, похоронен в Москве на Введенском кладбище (29 уч.).