Геоботаник, ресурсовед, путешественник, большой знаток лекарственной флоры и народной медицины, основоположник науки - алкалоидная химия. В 1922-1965 гг. работал в Научно-исследовательском химико-фармацевтическом институте, заведовал химико-ботанической лабораторией. С 1922 по 1965 г. провел более 30 дальних экспедиций в Среднюю Азию, Казахстан, Закавказье, на Кавказ и Алтай. За годы исследовательской работы им было открыто почти 500 алкалоидов - действующих начал в лекарственных растениях. Он также разработал новый рациональный метод поисков лекарственных растений. Автор статей, очерков, научных и научно-популярных книг о ботанике, фармакогнозии и фармакологии, о медоносных и эфирномасличных растениях. Имеет государственные награды.
     Скончался П.С. Массагетов в 1972 году, похоронен в Москве на Введенском кладбище.